因怕宰相專製，對皇權造成威脅。朱慈烺時期就開始改革，到了建文四年。內閣製度，成了皇帝谘政的專門機構。

大明的奇葩皇帝不少，很多墮與政務的皇帝，就想做甩手掌櫃。可是，有為了避免臣子專權，內閣製度就開始顯現，內閣的權利也逐漸增大。

很快，內閣成為明朝行政中樞。內閣輔臣的人數為一人至七人不等，輔臣奉使出外辦事，多自稱閣部。

起初，內閣大學士隻具有顧問身份，皇帝為最終決定的權力，而大學士很少有參決的機會。到明仁宗、明宣宗時期，地位日益受尊崇。自此，內閣的權力日益增大。到明世宗中葉，夏言、嚴嵩等人執掌內閣，地位赫然為真正的宰相，亦可壓製六部。

然而，雖然首席內閣大學士就是我們所稱的內閣首輔有票擬的權力，但卻不得不依賴於內部太監送達批紅。首輔大學士的職權如同以往的丞相，但必須與宦官合作，才能執掌大政，如張居正結合馮保。

內閣製度的延續，遇到個忠臣，依舊可以使得大明朝政體係良性運轉。且不說張居正功過，至少張居正此人對大明是有大功勞的。

明成祖皇帝朱棣成立內閣以後，把原來宰相擁有的決策權牢牢把持在自己手中，議政權分給內閣，行政權分給六部。地方上分三司，分管司法、軍事、行政，直接對六部負責。

在大明國力昌盛的情況下，，內閣與六部各司其職，國家最高行政命令從紫禁城發出，通過全國近兩千處驛站，全長十四萬三千七百公裡的驛道，層層下發到國家每一個角落。

這也是為什麼後來崇禎皇帝裁撤掉驛站，引發了一係列的連鎖反應的原因。

而內閣，則成了朝廷的重中之重。能夠進入內閣的臣子，都是社稷的棟梁，群臣的表率，中流支柱。